基于转录组学和蛋白质组学的高海拔肺动脉热力大鼠模型的新靶点

气管真空（PH）是指静息时最少气管压≥25 mmHg。 它根据血移动力学时特征、发病功能和药理学时分为五类。 第三类荒漠气管真空（HAPH）是由于在荒漠诱发生存环境中的肺循环系统量代偿官能增加和肺小动脉血管收缩造成了的，造成平原心肌病。 病理症状还包括慢速呼吸困难、头痛和疲劳。 HAPH 有可能反映了未能适可不荒漠，并伴有不清楚的病理生理功能。 将近有 1.4 亿人生活在山坡 2,500 米以上的邻近地区，每年有超过 4,000 上千人访问这些荒漠邻近地区。 诱发造成循环系统介导著者频发相似之处改变； 这大概长期聚居在荒漠邻近地区的居民及其后代的核糖体型适可不官能改变中的得知的。HAPH 的病人仍在科学研究中的。可不建议患者移至高山坡邻近地区，氧疗有效地。制剂病人的科学研究仅限于一些随机试验官能。 HAPH 的病理与其他类型的 PH 相似，因此值得考虑对 PAH 有效地的制剂有否对 HAPH 有效地。

然而，所有这些小分子制剂都在HAPH中的的有效地官能和功能已为不清楚。为知晓决这个问题，我们意在科学研究诱发所涉及的分子会功能，用于小鼠 HAPH 模型，并可不用中心等均会学时方法有。 在此操作过程中的，我们意在科学研究几种小分子制剂和复氧的作用，以已确定荒漠造成了的诱发的潜在新病人靶点。 特别是，我们科学研究了小分子制剂如何影响循环系统之间的相似之处核糖体和核糖体暗示。

科学研究设计：

将小鼠置于 10% O2（诱发）四楼中的 3 周以转化成 PH。相符合小鼠（C 组）在整个实验中的都处于常氧生存环境下，并在病人期间（即从第 21 天开始）用载体顺利完成病人。 3周时，其余小鼠随机分为六组；一组被处死（第 21 天）以评估心肺功能官能。其余 5 组用小分子制剂或复氧病人，从第 21 天到第 35 天处死。慢官能诱发，载体处理（M）；慢官能诱发，司来帕格病人；慢官能诱发，诺瓦替坦病人；慢官能诱发，riociguat 病人；慢官能诱发、复氧 (RE)。

转录组分析方法：

提取总 RNA，并通过用于 Arraystar rRNA Removal Kit 去除 rRNA 来可溶性 mRNA 和非编码 RNA。 mRNA 和非编码 RNA 被片段化缓冲液生成首集段（~200-500 nt）。以首集段为模版，透过随机六聚体引物催化第一双链cDNA。在第二双链催化操作过程中的，dTTP 被 dUTP 替换。 然后加入洗脱缓冲液以通过末端复建和附加腺嘌呤来转化和除去首集段。 首集段被转化并与接头联接； 用于SAM-N-半乳糖酶消化第二条双链。 琼脂糖凝胶电泳后，选项适当的片段作为模版顺利完成PCR导入。 用于 Agilent 2100 生物分析方法仪和 ABI StepOnePlus 实时 PCR 系统对探针库顺利完成分析方法方法和数量级评估。 该文库用于 Illumina HiSeq 2000 系统顺利完成测序。

LC-MS/MS 分析方法

在联接到 Easy-nLC 1000 液相色著者系统的Q Exactive HF 质著者仪上分析方法探针。将湿气的肽探针之后溶解在溶剂 A（0.1% 硫酸水溶液）中的并加载到捕集柱中的用于溶剂 A 的最大压力为 280 bar，然后在自制的 150 μm × 30 cm 硅胶微柱上以 5–35% 的局部顺利完成除去移动相 B（二氯甲烷和 0.1% 硫酸），流速为 600 nl/min，停滞 150 分钟。 QE HF 的 MS 分析方法是在 3e6 原子的自动增益控制目标下顺利完成一次全读取，然后顺利完成多达 30 次与信息关的的 MS/MS 读取具有更高能量的碰撞解离，在 Orbitrap 中的验证到（R = 15,000 在 200 m/z）。

科学研究结果：

基于RNA-seq信息的共暗示的网络的功能官能可溶性分析方法和主干线分子会鉴定。

基于核糖体信息的共暗示的网络的功能官能可溶性分析方法和主干线分子会鉴定。

RNA-seq 和方法有学时揭示了对三种制剂的反可不之间的强关的官能，具有几乎相同的效果。GO 可溶性显示相似之处暗示的核糖体还包括作准备代谢适度、转录和翻译的核糖体。

司来帕格、诺瓦替坦和复氧可改善 HAPH。Serpina1、Cryz 和 Cmc1 被鉴定出来，通过均会学时筛选，作为作准备HAPH的极其重要核糖体。这些注意到为 HAPH 的小分子制剂功能发放了新的见解。

科学研究结论：

Selexipag、macitentan 和复氧显着移向了小鼠 HAPH 模型，而 riociguat 的作用较弱。 相似之处暗示的核糖体作准备代谢调控、转录和翻译。 某些核糖体受到 HAPH 和病人的影响。 我们用于均会学时方法有筛选了极其重要核糖体 Serpina1、Cryz 和 Cmc1。 这些注意到有可能有效地地更好地知晓诱发所涉及的分子会功能，并有可能发放新的病人靶点。

文献记事：

Xu X, Li H, Wei Q, Li X, Shen Y, Guo G, Chen Y, He K, Liu C. Novel Targets in a High-Altitude Pulmonary Hypertension Rat Model Based on RNA-seq and Proteomics. Front Med (Lausanne). 2021 Nov 3;8:742436. doi: 10.3389/fmed.2021.742436. PMID: 34805208; PMCID: PMC8595261.